David,<br><br>gdalwarp should stop eliminating outliers when it can&#39;t find any more. But to be sure you can pass the minimum number of GCPs. Also, the argument <i>tolerance</i> is the tolerance in GCP&#39;s SRS units. Since the outliers are indicated by (-9999,-9999) and our GCPs can go between -180 and 180, anything between 360 and 9000 can be given as tolerance.<br>
<br>BTW, there is no need for -s_srs because we are using GCPs.<br><br>Do let us know how it goes.<br><br><div class="gmail_quote">On Sat, Jan 28, 2012 at 6:57 AM, David Ortiz <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:dvdov@yahoo.com">dvdov@yahoo.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="font-size:12pt;font-family:times new roman,new york,times,serif"><div style="font-family:&#39;times new roman&#39;,&#39;new york&#39;,times,serif;font-size:12pt">
<span><span style="font-family:Arial;font-size:13px">Chaitanya,</span><br></span></div><div><font face="Arial"><br></font></div><div><font face="Arial">This image have 329 GCPs and 41 of them are not outliers , can i put 
<span style="font-family:&#39;courier new&#39;,monospace;font-size:16px">-refine_gcps 329 41 </span></font><span style="font-family:Arial;font-size:13px">in the command ?</span></div><div><span style="font-family:Arial;font-size:13px"><br>
</span></div><div><span style="font-family:Arial;font-size:13px"><br></span></div><div><span style="font-family:Arial;font-size:13px"><br></span></div><div><span style="font-family:Arial;font-size:13px">--</span></div><div>
<span style="font-family:Arial;font-size:13px">David A. Ortiz V</span></div><div style="font-family:&#39;times new roman&#39;,&#39;new york&#39;,times,serif;font-size:12pt"><br></div><div style="font-family:&#39;times new roman&#39;,&#39;new york&#39;,times,serif;font-size:12pt">
<br></div><div style="font-family:&#39;times new roman&#39;,&#39;new york&#39;,times,serif;font-size:12pt"></div><div style="font-size:12pt;font-family:&#39;times new roman&#39;,&#39;new york&#39;,times,serif"> <div style="font-size:12pt;font-family:&#39;times new roman&#39;,&#39;new york&#39;,times,serif">
 <div dir="ltr"> <font face="Arial"><div class="im"> <hr size="1">  <b><span style="font-weight:bold">De:</span></b> Chaitanya kumar CH &lt;<a href="mailto:chaitanya.ch@gmail.com" target="_blank">chaitanya.ch@gmail.com</a>&gt;<br>
 <b><span style="font-weight:bold">Para:</span></b> David Ortiz &lt;<a href="mailto:dvdov@yahoo.com" target="_blank">dvdov@yahoo.com</a>&gt; <br><b><span style="font-weight:bold">CC:</span></b> &quot;<a href="mailto:gdal-dev@lists.osgeo.org" target="_blank">gdal-dev@lists.osgeo.org</a>&quot; &lt;<a href="mailto:gdal-dev@lists.osgeo.org" target="_blank">gdal-dev@lists.osgeo.org</a>&gt; <br>
 </div><b><span style="font-weight:bold">Enviado:</span></b> Jueves, enero 26, 2012 10:49 P.M.<div class="im"><br> <b><span style="font-weight:bold">Asunto:</span></b> Re: [gdal-dev] HDF-EOS AIRS CO2 images without georeference using
 gdal_translate<br> </div></font> </div><div><div class="h5"> <br><div>David,<br><br>I checked the images I created now. The GCPs were not considered. So, I made sure they were used with gdalwarp.<br><span style="font-family:&#39;courier new&#39;,monospace">gdalwarp -s_srs &quot;EPSG:4326&quot; -t_srs &quot;EPSG:4326&quot; -refine_gcps 200 10 -of GTiff HDF4_EOS:EOS_SWATH:&quot;AIRS.2008.03.12.228.L2.CO2_Sup.v5.4.11.0.CO2.T09254115637.hdf&quot;:CO2:CO2ret  CO2_sup_Gtiff_EOS_warp.tif</span><br>


I used the -refine_gcps. It will help in excluding the dummy gcps 
pointing to (-9999,-9999,0). In this option, the number of minimum_gcps 
had to be given. I chose the number 10 based on the number of usable 
GCPs available. It should not be more than the number of usable GCPs. If I did not exclude the dummy gcps, I got black image.<br>
<br>Also note that the output image dimensions changed.<br><br><div>On Fri, Jan 27, 2012 at 7:26 AM, David Ortiz <span dir="ltr">&lt;<a rel="nofollow" href="mailto:dvdov@yahoo.com" target="_blank">dvdov@yahoo.com</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="font-size:12pt;font-family:&#39;times new roman&#39;,&#39;new york&#39;,times,serif"><div style="font-size:12pt">
<span>Hi Chaitanya</span></div><div style="font-size:12pt"><span><br></span></div><div style="font-size:12pt">
<span style="font-size:12pt"><br></span></div><div style="font-size:12pt"><span style="font-size:12pt">Applying </span><span style="font-size:12pt">gdalinfo -stats to input and output images i get coherent values  for statistics in both .img  and GTiff  images. The problem was in data display in GIS since QGIS show a Gtiff image with all pixel values equal to zero when i use &quot;identify spatial objects&quot; tool and ArcGIS
  doesn&#39;t display it correctly , just two lines and no data, but </span><font size="3">gvSIG  allows see the </font>appropriate<font size="3"> values of CO2 amounts.</font></div><div style="font-size:12pt">
<br></div><div style="font-size:12pt">However, neither the .img nor GTiff have geographical spatial reference in WGS84 datum coordinates. Even opening  subdatasets directly from hdf file <span style="font-size:12pt">with ArcGis , the images are missing georeference. As it is seen below, hdf image is between -133.57, -157.94 longitudes and 22.23, 45.88 latitudes. I mentioned HDF_SDS:UNKNOWN datasets on previous post because it have some info about coordinate reference system:</span></div>

<div><div style="font-size:12pt">SRS=GEOGCS[&quot;WGS
 84&quot;,DATUM[&quot;WGS_1984&quot;,SPHEROID[&quot;WGS 84&quot;,6378137,298.257223563,AUTHORITY[&quot;EPSG&quot;,&quot;7030&quot;]],TOWGS84[0,0,0,0,0,0,0],AUTHORITY[&quot;EPSG&quot;,&quot;6326&quot;]],PRIMEM[&quot;Greenwich&quot;,0,AUTHORITY[&quot;EPSG&quot;,&quot;8901&quot;]],UNIT[&quot;degree&quot;,0.0174532925199433,AUTHORITY[&quot;EPSG&quot;,&quot;9108&quot;]],AUTHORITY[&quot;EPSG&quot;,&quot;4326&quot;]]<br>

</div></div><div style="font-size:12pt"><span style="font-size:12pt">Actually , when i load Geotiff generated with HEGTool </span><span style="font-size:12pt">(with other AIRS products) </span><span style="font-size:12pt">in any gis software , automatically have wgs84 Datum coordinates</span><br>

</div><div style="font-size:12pt"><span style="font-size:12pt"><br></span></div><div style="font-size:12pt">
<span style="font-size:12pt">Here the results of gdalinfo command:</span></div><div style="font-size:12pt"><span style="font-size:12pt">1. Input image</span><br>
</div><div><div><br></div><div>gdalinfo -stats HDF4_EOS:EOS_SWATH:&quot;/home/david/Descargas/pruebas/AIRS.2008.03.12.228.L2.CO2_Sup.v5.4.11.0.CO2.T09254115637.hdf&quot;:CO2:CO2ret </div><div>Driver: HDF4Image/HDF4 Dataset</div>

<div><div>                   ...</div><div><div>Corner Coordinates:</div><div>Upper Left  (    0.0,    0.0)</div><div>Lower Left  (    0.0,   22.0)</div><div>Upper Right (   15.0,    0.0)</div><div>Lower Right (   15.0,   22.0)</div>

<div>Center      (    7.5,   11.0)</div><div>Band 1 Block=15x22 Type=Float32, ColorInterp=Gray</div></div><div>  Min=379.197 Max=393.697 </div><div>  Minimum=379.197, Maximum=393.697, Mean=386.463,
 StdDev=3.071</div><div>  NoData Value=-9999</div><div>  Metadata:</div><div>    STATISTICS_MAXIMUM=393.6969909668</div><div>    STATISTICS_MEAN=386.46261742001</div><div>    STATISTICS_MINIMUM=379.1969909668</div><div>    STATISTICS_STDDEV=3.0709672735453</div>

<div><br></div><div>2.  with Geotiff output  image : </div><div><div>gdalinfo -stats  /home/david/Descargas/pruebas/EOS/CO2_sup_Gtiff_EOS_traslate.tif</div><div>Driver: GTiff/GeoTIFF</div><div>Files: /home/david/Descargas/pruebas/EOS/CO2_sup_Gtiff_EOS_traslate.tif</div>

<div>       /home/david/Descargas/pruebas/EOS/CO2_sup_Gtiff_EOS_traslate.tif.aux.xml</div><div><div>Size is 15, 22</div><div>Coordinate System is `&#39;</div></div><div>GCP Projection = </div><div>GCP[  0]: Id=1, Info=</div>

<div>          (0.5,0.5) -&gt; (-9999,-9999,0)</div><div>GCP[  1]: Id=2,
 Info=</div><div>          (1.5,0.5) -&gt; (-9999,-9999,0)</div><div>GCP[  2]: Id=3, Info=</div><div>          (2.5,0.5) -&gt; (-9999,-9999,0)</div><div>GCP[  3]: Id=4, Info=</div><div>          (3.5,0.5) -&gt; (-145.229995727539,23.3500003814697,0)</div>

<div>GCP[  4]: Id=5, Info=</div><div>          (4.5,0.5) -&gt; (-9999,-9999,0)</div><div>               ... </div><div><div>GROUP                  = HORIZONTALSPATIALDOMAINCONTAINER</div><div>      GROUP                  = BOUNDINGRECTANGLE</div>

<div>        OBJECT                 = EASTBOUNDINGCOORDINATE</div><div>          NUM_VAL        
      = 1</div><div>          VALUE                = -133.537399291992</div><div>        END_OBJECT             = EASTBOUNDINGCOORDINATE</div><div>        OBJECT                 = WESTBOUNDINGCOORDINATE</div><div>          NUM_VAL              = 1</div>

<div>          VALUE                = -157.941314697266</div><div>        END_OBJECT             = WESTBOUNDINGCOORDINATE</div><div>        OBJECT                 = SOUTHBOUNDINGCOORDINATE</div><div>          NUM_VAL            
  = 1</div><div>          VALUE                = 22.2317676544189</div><div>        END_OBJECT             = SOUTHBOUNDINGCOORDINATE</div><div>        OBJECT                 = NORTHBOUNDINGCOORDINATE</div><div>          NUM_VAL              = 1</div>

<div>          VALUE                = 45.889762878418</div><div>        END_OBJECT             = NORTHBOUNDINGCOORDINATE</div><div>      END_GROUP              = BOUNDINGRECTANGLE</div><div>               ... </div></div>

<div>  INTERLEAVE=BAND</div><div><div>Corner
 Coordinates:</div><div>Upper Left  (    0.0,    0.0)</div><div>Lower Left  (    0.0,   22.0)</div><div>Upper Right (   15.0,    0.0)</div><div>Lower Right (   15.0,   22.0)</div><div>Center      (    7.5,   11.0)</div><div>

Band 1 Block=15x22 Type=Float32, ColorInterp=Gray</div></div><div>  Minimum=379.197, Maximum=393.697, Mean=386.463, StdDev=3.071</div><div>  NoData Value=-9999</div><div>  Metadata:</div><div>    STATISTICS_MAXIMUM=393.6969909668</div>

<div>    STATISTICS_MEAN=386.46261742001</div><div>    STATISTICS_MINIMUM=379.1969909668</div><div>    STATISTICS_STDDEV=3.0709672735453</div><div>              </div><div>3. .img image :</div><div><br></div><div>gdalinfo -stats /home/david/Descargas/pruebas/EOS/CO2_sup_img_EOS.img</div>

<div>Driver: HFA/Erdas Imagine
 Images (.img)</div><div>Files: /home/david/Descargas/pruebas/EOS/CO2_sup_img_EOS.img</div><div>       /home/david/Descargas/pruebas/EOS/CO2_sup_img_EOS.img.aux.xml</div><div><div>Size is 15, 22</div><div>Coordinate System is `&#39;</div>

<div>               ... </div></div><div><div>GROUP                  = SPATIALDOMAINCONTAINER</div><div>    GROUP                  = HORIZONTALSPATIALDOMAINCONTAINER</div><div>      GROUP                  = BOUNDINGRECTANGLE</div>

<div>        OBJECT                 = EASTBOUNDINGCOORDINATE</div><div>          NUM_VAL              = 1</div><div>          VALUE    
            = -133.537399291992</div><div>        END_OBJECT             = EASTBOUNDINGCOORDINATE</div><div>        OBJECT                 = WESTBOUNDINGCOORDINATE</div><div>          NUM_VAL              = 1</div><div>          VALUE                = -157.941314697266</div>

<div>        END_OBJECT             = WESTBOUNDINGCOORDINATE</div><div>        OBJECT                 = SOUTHBOUNDINGCOORDINATE</div><div>          NUM_VAL              = 1</div><div>          VALUE          
      = 22.2317676544189</div><div>        END_OBJECT             = SOUTHBOUNDINGCOORDINATE</div><div>        OBJECT                 = NORTHBOUNDINGCOORDINATE</div><div>          NUM_VAL              = 1</div><div>          VALUE                = 45.889762878418</div>

<div>        END_OBJECT             = NORTHBOUNDINGCOORDINATE</div><div>      END_GROUP              = BOUNDINGRECTANGLE</div><div>               ... </div></div><div><div>Corner Coordinates:</div><div>Upper Left  (    0.0,    0.0)</div>

<div>Lower Left  (    0.0,  
 22.0)</div><div>Upper Right (   15.0,    0.0)</div><div>Lower Right (   15.0,   22.0)</div><div>Center      (    7.5,   11.0)</div></div><div>Band 1 Block=64x64 Type=Float32, ColorInterp=Undefined</div><div>  Description = Layer_1</div>

<div>  Minimum=379.197, Maximum=393.697, Mean=386.463, StdDev=3.071</div><div>  NoData Value=-9999</div><div>  Metadata:</div><div>    LAYER_TYPE=athematic</div><div>    STATISTICS_MAXIMUM=393.6969909668</div><div>    STATISTICS_MEAN=386.46261742001</div>

<div>    STATISTICS_MINIMUM=379.1969909668</div><div>    STATISTICS_STDDEV=3.0709672735453</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>What is wrong?. I tried with gdal 1.8 and 1.9 with hdf4 support.</div><div>

<br></div><div><br></div><div>Best regards.</div></div></div></div><span><font color="#888888"><div style="font-size:12pt">--</div><div style="font-size:12pt">
<br></div><div style="font-size:12pt">David Ortiz V.</div></font></span><div style="font-size:12pt">
<br></div></div></div></blockquote></div><br>
</div> </div></div></div> </div>  </div></div></blockquote></div><br clear="all"><br>-- <br>Best regards,<br>Chaitanya kumar CH.<br><br>+91-9494447584<br>17.2416N 80.1426E<br>