<div dir="ltr">Thanks for your suggestion, Jukka! I tried all the advice from stackoverflow. I can do ".recover", but get only the features that have been visible all along. <div>In the original .gpkg, I cannot DROP the affected RTree-Index. It gives me the same disk malformed error. But that would also have been my initial idea... </div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Feb 14, 2022 at 9:26 AM Rahkonen Jukka (MML) <<a href="mailto:jukka.rahkonen@maanmittauslaitos.fi">jukka.rahkonen@maanmittauslaitos.fi</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">





<div lang="FI" style="overflow-wrap: break-word;">
<div class="gmail-m_-6478420901317346237WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span>Hi,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">Without being able to see your database it is hard to give more advice that
<a href="https://stackoverflow.com/questions/18259692/how-to-recover-a-corrupt-sqlite3-database/18260642" target="_blank">
https://stackoverflow.com/questions/18259692/how-to-recover-a-corrupt-sqlite3-database/18260642</a> gives. Did you try all of them? Because the problem has something to do with the spatial index I would have a try be dropping it and repeating the suggested
 tricks.<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">-Jukka Rahkonen-<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><u></u> <u></u></span></p>
<div style="border-right:none;border-bottom:none;border-left:none;border-top:1pt solid rgb(225,225,225);padding:3pt 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b>Lähettäjä:</b> gdal-dev <<a href="mailto:gdal-dev-bounces@lists.osgeo.org" target="_blank">gdal-dev-bounces@lists.osgeo.org</a>>
<b>Puolesta </b>Isabel Kiefer<br>
<b>Lähetetty:</b> maanantai 14. helmikuuta 2022 10.17<br>
<b>Vastaanottaja:</b> <a href="mailto:gdal-dev@lists.osgeo.org" target="_blank">gdal-dev@lists.osgeo.org</a><br>
<b>Aihe:</b> [gdal-dev] Corrupted geopackage<u></u><u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Hi everyone,<u></u><u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">I've a problem with a corrupted geopackage. <u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">It should contain a table with 694 entries, but only 78 are visible when opening the file with DB Browser for SQLite or QGIS. The table gpkg_ogr_contents says 694 though. When opening the .gpkg with a Notepad or similar, I can see that
 there are more than 78 entries.<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">The error message in DB Browser is "database disk image is malformed in "PRAGMA "main".TABLE_INFO("rtree_XXX");" So it seems that there is a problem with the index of the concerned table.<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Does anyone know how to fix this? I tried  <a href="https://stackoverflow.com/questions/18259692/how-to-recover-a-corrupt-sqlite3-database/18260642" target="_blank">
<span style="font-size:10.5pt;font-family:Roboto">https://stackoverflow.com/questions/18259692/how-to-recover-a-corrupt-sqlite3-database/18260642</span></a> but without success.<br clear="all">
<u></u><u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Thanks in advance for your help!<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Isabel<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal">-- <u></u><u></u></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Arial,sans-serif">Isabel Kiefer</span><u></u><u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Arial,sans-serif">OPENGIS.ch</span><u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:7.5pt;font-family:Arial,sans-serif"><a href="mailto:isabel@opengis.ch" target="_blank">isabel@opengis.ch</a></span><u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div>