<div dir="ltr"><br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Dec 3, 2015 at 4:42 PM, Anna Petrášová <span dir="ltr"><<a href="mailto:kratochanna@gmail.com" target="_blank">kratochanna@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote"><span class="">On Thu, Dec 3, 2015 at 10:26 AM, Paulo van Breugel <span dir="ltr"><<a href="mailto:p.vanbreugel@gmail.com" target="_blank">p.vanbreugel@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>From the r.series manual I thought that the <i>file</i> option allows one to analyze large amount of raster maps 
without hitting open files limit and the size limit of command line 
arguments. Yet, when using the r.series with as input a file with 994 raster layers, I am still getting an error message about "too many open files" <br><br>GRASS 7.1.svn (Data_latlon):~ > r.series --overwrite file=a.txt output=Spec_rich method=count range=1,2<br>WARNING: G__open(read): Unable to open<br>         '/media/HD2/Data/GRASSdb/Data_latlon/VECEA_species/cellhd/maxent_v1_Hyparrhenia_rufa_rcp45_2055_ens_mean_wc60s_presabs':<br>         Too many open files<br><br></div>The mentioned layer is the 551th layer out of a list of 996 layers.<br><br></div><div>Did I misunderstood this 'file' option?</div></div></blockquote><div><br></div><div><br></div></span><div>Try to use z flag. I think the manual is wrong:</div><div><br></div><div><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:medium">Use the </span><i style="color:rgb(0,0,0);font-size:medium">file</i><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:medium"> option to analyze large amount of raster maps without hitting open files limit and the size limit of command line arguments. The computation is slower than the </span><i style="color:rgb(0,0,0);font-size:medium">input</i><span style="color:rgb(0,0,0);font-size:medium"> option method. For every sinlge row in the output map(s) all input maps are opened and closed.</span></div><div><br></div><div>Anna</div></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>The -z flag works perfectly, thanks. I though I would provide a patch with an update of the manual page, but to do so, I need to understand it correctly;<br><br></div><div>What I understand now is that the -z flag is to avoid the open file limit, while the file option is to avoid the comman line size limit?<br><br></div><div>If that is true, for which (or both) the following still applies:<br><br>"The computation is slower as for every sinlge row in the <br>output map(s) all input maps are opened and closed. The amount of <br>RAM will rise linear with the number of specified input maps."<br></div><div><br><br></div><div><br> <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span class=""><div dir="ltr"><div><span><font color="#888888"><br><br></font></span></div><div><span><font color="#888888">Paulo<br></font></span><br></div><div>p.s., Running GRASS GIS trunk on Linux<br></div></div>
<br></span>_______________________________________________<br>
grass-dev mailing list<br>
<a href="mailto:grass-dev@lists.osgeo.org" target="_blank">grass-dev@lists.osgeo.org</a><br>
<a href="http://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/grass-dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/grass-dev</a><br></blockquote></div><br></div></div>
</blockquote></div><br></div></div>