Alex,<div><br></div><div>I believe Tyler does plan on using R for the statistical analyses, but using GRASS GIS in combination with R is the easiest path, I think.</div><div><br></div><div>Tom<span></span><br><br>On Tuesday, March 11, 2014, Alex Mandel <<a href="mailto:tech_dev@wildintellect.com">tech_dev@wildintellect.com</a>> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Use R. It includes Moran's I and Geary's C tests for<br>
spatial-autocorrelation. Look like it has  mantel too.<br>
<br>
You'll probably need the sp, spdep and rgdal packages. You might also<br>
want to use the Raster package to extract the sampling data, or you can<br>
use spGRASS to tie the R and Grass together.<br>
<br>
See chapter 9 (1st ed) of Applied Spatial Data Analysis with R.<br>
<a href="http://www.asdar-book.org/" target="_blank">http://www.asdar-book.org/</a><br>
<br>
Enjoy,<br>
Alex<br>
<br>
On 03/11/2014 09:18 AM, Tyler Smith wrote:<br>
> Hello,<br>
><br>
> We're preparing a field sampling program, and would like to determine<br>
> a minimum distance between samples to reduce/eliminate spatial<br>
> autocorrelation. I think a good approach would be to calculate a<br>
> mantel correlogram, and use the range of the correlogram as our<br>
> minimum sampling distance.<br>
><br>
> * Questions<br>
><br>
> 1) is this a reasonable approach<br>
> 2) if so, how best to do this?<br>
><br>
> * Details<br>
> We have a vector map with the point coordinates of several hundred<br>
> potential sampling sites, and ~ 10 raster layers with appropriate data<br>
> to test for spatial autocorrelation (WORLDCLIM, soils). I could do<br>
> something like the following, but I'm not sure if there's a simpler or<br>
> more appropriate approach:<br>
><br>
> 1) extract the raster data for each point<br>
> 2) save the data to csv; import into R<br>
> 3) calculate the spatial distances between points, after projecting<br>
> the lat-long data into an appropriate scale (?)<br>
> 4) calculate the climate distance using the WORLDCLIM data<br>
> 5) use the 'mgram' function in the 'ecodist' package to calculate the<br>
> actual correlogram between the spatial distance and climate distance<br>
><br>
> Any suggestions on the approach or the methods would be welcome!<br>
><br>
> Thanks,<br>
><br>
> Tyler<br>
> _______________________________________________<br>
> grass-user mailing list<br>
> <a href="javascript:;" onclick="_e(event, 'cvml', 'grass-user@lists.osgeo.org')">grass-user@lists.osgeo.org</a><br>
> <a href="http://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/grass-user" target="_blank">http://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/grass-user</a><br>
><br>
<br>
_______________________________________________<br>
grass-user mailing list<br>
<a href="javascript:;" onclick="_e(event, 'cvml', 'grass-user@lists.osgeo.org')">grass-user@lists.osgeo.org</a><br>
<a href="http://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/grass-user" target="_blank">http://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/grass-user</a><br>
</blockquote></div><br><br>-- <br>Thomas E Adams, III<div>718 McBurney Drive</div><div>Lebanon, OH 45036</div><div><br></div><div>1 (513) 739-9512 (cell)</div><div><br></div><br>