<html style="direction: ltr;">
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
    <style type="text/css">body p { margin-bottom: 0cm; margin-top: 0pt; } </style>
  </head>
  <body bidimailui-charset-is-forced="true" style="direction: ltr;"
    text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    <br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 19/11/2018 12:41, Markus Neteler
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CALFmHhsKV2YKdEzh8efsRfDvhOHoWMFtFFou3WczEs5D93gEVg@mail.gmail.com">
      <pre wrap="">On Sun, Nov 18, 2018 at 10:32 PM Micha Silver <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:tsvibar@gmail.com"><tsvibar@gmail.com></a> wrote:
</pre>
      <blockquote type="cite">
        <pre wrap="">
I am preparing a correlation matrix for 7 raster layers. The results using the r.covar module are different from the R layerStats function. I suspect this is due to handling of null cells. The R function has a parameter to remove NA cells, but the GRASS module, I think, just loops over all cells, including no value.


Can anyone confirm that GRASS does not deal with null cells, and that this would cause the difference in correlation results?
</pre>
      </blockquote>
      <pre wrap="">
Here how r.covar treats NULL cells:

<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://trac.osgeo.org/grass/browser/grass/trunk/raster/r.covar/main.c#L93">https://trac.osgeo.org/grass/browser/grass/trunk/raster/r.covar/main.c#L93</a></pre>
    </blockquote>
    Hi Markus<br>
    Thanks, I missed those lines when I glanced over the source (not a C
    programmer).<br>
    I'll do some more testing to try to understand why I'm getting
    different results from R compared to GRASS.  <br>
     <br>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CALFmHhsKV2YKdEzh8efsRfDvhOHoWMFtFFou3WczEs5D93gEVg@mail.gmail.com">
      <pre wrap="">

Markus
</pre>
    </blockquote>
    <br>
    <pre class="moz-signature" cols="72">-- 
Micha Silver
Ben Gurion Univ.
Sde Boker, Remote Sensing Lab
+972-523-665918</pre>
  </body>
</html>