For specific usages (individual point processing and interaction with other geometries) I&#39;m using <a href="http://postgis.refractions.net/">Postgis</a>. However, I don&#39;t know of any way to directly load .las files.(GPL)<br>
<br>R (<a href="http://www.r-project.org/">http://www.r-project.org/</a>)  is also a nice tool for particular processing however it doesn&#39;t hold lots of points at the same time and it&#39;s slower than C++ but you have access to a panoply of (statistical) tools. (copyleft)<br>
<br>That said, it&#39;s a nice question and I&#39;m happy to learn about new tools !<br><br>Etienne<br>