<span class="gmail_quote"></span>I don't quite remember the details too much, but I think that you need to have R_HOME declared at the time you start postmaster, so if you change R_HOME, you need to restart postmaster as well.
<br><br>David<br><br><div><div><span class="e" id="q_10e3e402a79c002b_1"><span class="gmail_quote">
On 10/12/06, <b class="gmail_sendername">Jeff Cavner</b> <<a href="mailto:jcavner@edac.unm.edu" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">jcavner@edac.unm.edu</a>> wrote:</span></span></div>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">













<div link="blue" vlink="purple" lang="EN-US">

<div><div><span class="e" id="q_10e3e402a79c002b_3">

<p><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;">In a post for March 2006 David Bitner had a nifty SQL function
using plr for natural breaks.  I have successfully installed R and plr in
postgress and created the function in my database but when called with select
kmeans(array[1,1,1,1,4,3,5,6,45,3,5,7,8,6,4,3,2,1,32,6,7,5,6,7,8],4);  to
test it , it reports  ERROR:  environment variable R_HOME not defined</span></font></p>

<p><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;"> </span></font></p>

<p><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;">I have noticed that when I run R from the command line I get
the line ignoring the R_HOME variable.  When installing plr, I had
problems with the make file finding R.h.  R.h lives in
/usr/local/lib/R/include.  But when I looked at the plr makefile I noticed
it was concatenating an extra /include onto the path.  So I set R_HOME
using export R_HOME=/usr/local/lib/R (one directory up from the actual location
of R.h)  since running my sql call to the kmeans function I have changed
R_HOME back to the actual location of R.h.  No path setting for R_HOME
seems to allow me to call the kmeans function.  Each returns the same
R_HOME error. Does any body know where R_HOME is actually supposed to be set,e.g.
to  the R.h, the .so, the /bin?   And if anyone has had this
problem why R_HOME works for the plr install but not the actual execution of
the function kmeans?</span></font></p>

<p><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;"> </span></font></p>

<p><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;">Jeff Cavner</span></font></p>

<p><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;">Earth</span></font><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;"> Data Analysis
 Center</span></font><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;"></span></font></p>

<p><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;">University</span></font><font face="Arial" size="2"><span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;"> of New Mexico</span></font><font face="Arial" size="2">

<span style="font-size: 10pt; font-family: Arial;"></span></font></p></span></div>

</div>

</div>



<br>_______________________________________________<br>postgis-users mailing list<br><a href="mailto:postgis-users@postgis.refractions.net" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">postgis-users@postgis.refractions.net
</a><br><a href="http://postgis.refractions.net/mailman/listinfo/postgis-users" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">http://postgis.refractions.net/mailman/listinfo/postgis-users</a><br>
<br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>************************************<br><span class="sg">David William Bitner

</span><br clear="all"><br>-- <br>************************************<br>David William Bitner