<div>                Hei!<br><br>As far as i remember from the courses i took in remote sensing (And i don't find any reason to believe that QGIS would have a different theory):<br> - The Residual error is calculated for every GCP( between the expected coordinate and the actual location). <br> - Then the total error is calculated by taking the RMS(Root mean square) of the residual errors. This would sum up the whole georeferencing. Some people take the worst residual to characterize the quality of the georeferencing. <br> - The RE for GCP points should be lower than half of the pixel size <br> - The georeferencing method changes the residual error, cause the estimation are based on the the georeferencing method. This might be observed as well if you toggle between for example 1st order polynomial and Helmert transformation.<br> - A low RE or RMSE does not say anything about the absolute position of the raster. It just describes how well the raster is referenced to the GCP's.<br> <br>Don't take my word for it though, i ask the community to correct me if i'm not saying it right.            </div>            <div class="yahoo_quoted" style="margin:10px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid #ccc;padding-left:1ex;">                        <div style="font-family:'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, sans-serif;font-size:13px;color:#26282a;">                                <div>                    On Monday, November 2, 2020, 10:18:30 PM GMT+1, Randal Hale <rjhale@northrivergeographic.com> wrote:                </div>                <div><br></div>                <div><br></div>                <div><div id="yiv6792867329">          <div>    <p>Good afternoon QGIS People <br>    </p>    <p>I received a question on RMSE errors in georeferencer and after      talking to Ethan about it I realized I have no clue what I'm      talking about. How would we go about calculating an RMSE for a      rectified image in QGIS? <br>    </p>    <p>I've cc'd ethan on this so he can chime in also. <br>    </p>    <p>Thanks <br>    </p>    <p>Randy<br>    </p>    <div class="yiv6792867329moz-forward-container"><br>      <br>      -------- Forwarded Message --------      <table class="yiv6792867329moz-email-headers-table" cellspacing="0" cellpadding="0" border="0">        <tbody>          <tr>            <th valign="BASELINE" nowrap="" align="RIGHT">Subject:            </th>            <td>Georeferencer Plugin Help - QGIS</td>          </tr>          <tr>            <th valign="BASELINE" nowrap="" align="RIGHT">Date: </th>            <td>Fri, 2 Oct 2020 15:27:13 +0000</td>          </tr>          <tr>            <th valign="BASELINE" nowrap="" align="RIGHT">From: </th>            <td>Ethan Cissell <a rel="nofollow" class="yiv6792867329moz-txt-link-rfc2396E" ymailto="mailto:ecissell@bio.fsu.edu" target="_blank" href="mailto:ecissell@bio.fsu.edu"><ecissell@bio.fsu.edu></a></td>          </tr>          <tr>            <th valign="BASELINE" nowrap="" align="RIGHT">To: </th>            <td><a rel="nofollow" class="yiv6792867329moz-txt-link-abbreviated" ymailto="mailto:info@northrivergeographic.com" target="_blank" href="mailto:info@northrivergeographic.com">info@northrivergeographic.com</a>              <a rel="nofollow" class="yiv6792867329moz-txt-link-rfc2396E" ymailto="mailto:info@northrivergeographic.com" target="_blank" href="mailto:info@northrivergeographic.com"><info@northrivergeographic.com></a></td>          </tr>        </tbody>      </table>      <br>      <br>            <span style="color:rgb(0, 0, 0);font-family:GillSans;" class="yiv6792867329">Hi Randal,</span>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        I have a question about the usage and outputs of the        Georeferencer Plugin in QGIS, and thought, given your expertise,        you might be able to directly help, or point me in the right        direction.</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        I am a Ph.D. candidate in Ecology and Evolution at Florida State        University applying spatial techniques to study the dynamics of        benthic cyanobacterial mats on coral reefs. This past summer, I        photographically tracked individual cyanobacterial mats in which        I had placed plastic stakes as ground control points for later        image rectification. I am trying to essentially create image        stacks, so that I can parameterize a generalized additive mixed        effects model that accounts for the inherent spatial        autocorrelation and includes a parameter with occupation at the        previous time-point explicitly included to hopefully model the        population dynamics of this system.</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        Thus, a quantitative understanding of the error in my alignment        is absolutely critical to the downstream conclusions (especially        for informing my resampling to larger grid size to account for        error in my alignments).</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        I am using QGIS for obtaining all raw data from these photos        (scaling, rectification, classification, resampling), but I am        stuck at the rectification step. I am using the “Georeferencer”        plugin to accomplish my alignments, but I have received mixed        advice on how to interpret the residuals output on the GCP table        in the Georeferencer window (screenshot below). The        documentation for this plugin seems to indicate that the far        right column (Residual) is actually a per GCP RMS error.</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        Can you tell me how to interpret these errors/how to obtain a        total RMSE error for the image alignment (i.e. not just per GCP        error, but total error for each image)? I have been told to sum        all of the values from the residuals column and take the square        root of that raw summation. Is this correct?</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        Many thanks in advance. I apologize for the lengthy email, but I        wanted to establish the motivations for this project so that you        would have more context for the goals of the alignment.</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        Any and all help here is greatly appreciated.</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        Best,</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        <br class="yiv6792867329">      </div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        Ethan C Cissell</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        ——————————————</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        Ph.D. Candidate - McCoy Lab</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        National Science Foundation Graduate Research Fellow</div>      <div class="yiv6792867329" style="color:rgb(0, 0,        0);font-family:GillSans;">        Florida State University</div>    </div>  </div></div>_______________________________________________<br>Qgis-user mailing list<br><a ymailto="mailto:Qgis-user@lists.osgeo.org" href="mailto:Qgis-user@lists.osgeo.org">Qgis-user@lists.osgeo.org</a><br>List info: <a href="https://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/qgis-user" target="_blank">https://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/qgis-user</a><br>Unsubscribe: <a href="https://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/qgis-user" target="_blank">https://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/qgis-user</a></div>            </div>                </div>