<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    As first step towards building a model as Nicolas has suggested:<br>
    I assume you have a layer with the county boundaries. Export this
    layer as a CSV file, keeping only the name of each county in the
    export step, and don't export the geometry.<br>
    Now open this file in your spreadsheet app of choice.<br>
    Add a new column for each plant species.<br>
    Put a one in that column for each county where the species is
    present.<br>
    Save the file (still as CSV).<br>
    <br>
    Open the county layer and the new CSV files in Ggis.<br>
    Open the properties window for the county layer and click on the
    Joins tab.<br>
    Click on the "+" to add a new join. Join to the CSV layer, and
    select the county names field as the join field for each.<br>
    <br>
    Now your county layer has the plant species column.<br>
    To display a single species, open the properties window for the
    county layer, select symbology. Set the symbology as rule based. To
    color just those counties with species 1, your rule would say
    something like Species1 = 1, where Species1 is the field name you
    used. Pick a color/transparency of your choice, then set the "all
    others" rules to be the background color you want.<br>
    <br>
    That does it for one species. You can then export to tiff or
    whatever. Getting it to cycle through all the different species is
    for someone else to explain.<br>
  </body>
</html>