<div dir="ltr"><div>Thanks so much Mr. Kirk for sharing your advice/guidance. </div><div>I confirm to you : No data values are well written to the header (-999). <br>Unfortunatly, for the raster segmentation step, the process is performed for the no data values area. </div><div><br></div><div>Thanks for sharing your alternative proposal/option : "using the raster calculator to reset these pixels to -999", no data values. </div><div>If i well understood your idea, you suggest to add an additional step on the first segmentation output raster. To enforce the no data value on this existing segmentation raster, before to </div><div>do the merge whole raster segmentation. Yes, i can try this method. But, i must confess that i never do this task : "Set no data values for a raster, only for a subset/area of the raster" : "Set/Define</div><div>No data values for pixels that (not) overloap with an input mask vector/or input mask raster" (set condition). </div><div>Thanks so much. </div></div><br><div class="gmail_quote gmail_quote_container"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Le ven. 13 juin 2025 à 13:12, celati Laurent <<a href="mailto:laurent.celati@gmail.com">laurent.celati@gmail.com</a>> a écrit :<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><span lang="en"><span><span>Hello again,</span></span></span></div><div><span lang="en"><span><span>Following to my previous own post I'm taking the liberty to do a first reaction/addition.</span></span> <span><span>I tried clipping my multispectral SPOT6 image with my BD FORET mask (clip a raster with a masking extent coverage) by setting the value -999 (16-bit signed output) for the no data values during clipping.</span></span><span><span>
This worked.</span></span> <span><span>But when I try segmentation with the OTB GRM tool on this image, the process isn't ignored in the areas for which I had assigned no data values.</span></span> <span><span>The tool segmented the entire image.</span></span> <span><span>I sharean additional screenshot showing the pixel values in an area of no data values.</span></span> <span><span>The values are indeed set on no data values for the multispectral SPOT6 input image.</span></span> <span><span>And you can clearly see that it assigned a value to my segmentation result. The process has been done for no data values also : <br></span></span></span><img src="cid:ii_mbupk31h1" alt="SS_raster_segmentation_spot6_nodatavalues.jpg" width="306" height="171"><br></div><div>Thanks.</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Le ven. 13 juin 2025 à 11:58, celati Laurent <<a href="mailto:laurent.celati@gmail.com" target="_blank">laurent.celati@gmail.com</a>> a écrit :<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Dear all,</div><div>I'm working in a QGIS environment (graphical interface). Specifically, I'm using a QGIS modeler. Thanks to the processing toolbar provides, i have access to QGIS, Grass, Saga, and Orfeo toolbox tools algo. My goal is to generate a segmentation for geographic area. For the segmentation, I use the OTB tool via QGIS "Generic region merging": <a href="https://www.orfeo-toolbox.org/CookBook-7.0/Applications/app_GenericRegionMerging.html" target="_blank">https://www.orfeo-toolbox.org/CookBook-7.0/Applications/app_GenericRegionMerging.html</a></div><br>The complexity comes from the fact that I want to contextualize/differentiate the parameters and input data required for the segmentation step,within my study area based on a land use layer/mask layer. So i want to define specific parameters/input data for the segmentation generated on forest areas. And other input data/segmentation parameters generated for non-forest areas (urban, agricultural). I therefore have a vector data set, "Forest DB mask," which allows me to locate/mask forest areas.<br><br><div>I therefore want to :</div><div><ol><li>Generate an initial "raster segmentation" from an aerial/satellite image with specific parameters for forest areas (segmentation calculation only for raster pixels that overlap my forest DB mask). Therefore, the calculation must NOT be performed/ be ignored for pixels not covered by this mask layer (agricultural, urban, etc.).</li><li>Then generate a second "raster segmentation" for the rest of the study area that was ignored/skiped during the first segmentation (segmentation calculation only for raster pixels that do not overlap my forest DB mask: agricultural, urban, etc.).</li><li>Then, once these two raster segmentations are complete, the idea is to merge them into a single raster. Then, generate a polygonization (raster to vector).</li></ol></div>This little workflow isn't really complicated. But I'm wondering if it's possible to do it in a QGIS modeling/graphical interface environment. I'd be interested in advice/ideas. Do I must to  clip input rasters with the forest DB masking layer? With a management/assignment of "no data values" to ignore the segmentation processing on areas not covered by the mask layer?<br><br>I've attached below a screenshot that allows you to display an input raster image (here a multispectral Spot6/7 satellite image) and the mask layer (vector forest DB mask) to better visualize the context.<br><div><br></div><div><img src="cid:ii_mbumvw3q0" alt="SS_MS_masque_bd_foret.jpg" width="346" height="491" style="margin-right: 0px;"><br><br></div><div>Thanks so much.</div><div><br></div><br></div>
</blockquote></div>
</blockquote></div>