[OSGeo Suomi] Re: Finland Digest, Vol 7, Issue 1

[Jukka Welling]

Hei!

Minulta löytyisi kiinnostusta kehittää vapaaseen lähdekoodiin perustuvaa geoinformatiikan tutkimus- ja oppimisympäristöä. Mitä tutkimukseen tulee, niin mielestäni voisi olla hedelmällistä tarkastella geoinformatiikan avointa lähdekoodia mahdollisimmaan avoimena dynaamisena järjestelmänä, joka on yksi kansainvälisen vuorovaikutuksen järjestelmä muiden järjestelmien joukossa ja niiden kanssa vuorovaikutksessa, unohtamatta kokonaan myöskään muiden alojen avoimen lähdekoodin ohjelmistoja. Itse olen huomannut SoMFA nimisen kemoinformatiikan ohjelmiston kokonaan kadonneen netistä (ollut vielä ainakin 2006 julkaisutietojen mukaan) ja vain tieteellisistä julkaisuista (2008)voi todeta sen olevan ystävällisestä pyynnöstä käyttöön saatavissa Oxfordin yliopistosta. 
     Itsestään selvää lienee laajojen tilasto-analyysiohjelmistojen (avoimessa lähdekoodissa ainakin R-ohjelmisto on  ollut myös tieteellisen kiinnostuksen kohteena) tarpeellisuus geoinformatiikalle, uusimmilta GeoDa:n webbisivuilta löytyy R-ohjelmiston käytöstä geoinformatiikassa materiaalia. GeoDa:n webbisivut ovat myös hyvä spatiaalianalyysi-aineiston lähde. Samaten perulaiset perunan jalostajat käyttävät uDig:ia yhdistettynä R-ohjelmistoon, mihin heidän mukaansa uDig  erinomaisesti sopii. Bayesilaisten analyysimenetelmien käytöstä geoinformatiikassa on ainakin MapWindown puitteissa olemassa jopa tieteellinen julkaisu.
   Mutta jopa  kemoinformatiikan alalta saattaa löytyä ympäristötieteelliselle geoinformatiikalle sopivaa täydennystä: Melko uudesta, 2,5 miljoonaa yhdistettä sisältävästä Zinc-tietokannasta voisi olla hyötyä vesistö-analyysien teossa: tekemällä kyselyn molekyylin rakenteen (tai sen osarakenteen) avulla saattaisi muutamalla valikkovalinnalla saada selville mikä yhdiste on kyseessä tai vihjettä minkä yhdisteiden hajoamis- tai synteesituote voisi olla kyseessä moninaisten ominaisuustietojen kera. Ehkäpä olen tässä asiassa muutaman vuoden aikaani edellä. Yleensä tällaiset tietokannat ovat lääkeyritysten yksityisomaisuutta ja liikesalaisuuksia, Zinc on myös varsinaisesti tarkoitettu lääketutkimuksen apuvälineeksi. 
   Samaten on olemassa avoimen lähdekoodin grafiikka-ohjelmistoja, joihin varmasti kannattaisi myös tutustua jossain välissä. 
    Tässäpä vain joitakin idean poikasia, joista toivottavasti on jotain hyötyä. Itse pyrin tällä hetkellä jakamaan aikaani lähinnä geo-, kemo- ja bioinformatiikan kesken.


Terveisin Jukka Welling


finland-request at lists.osgeo.org kirjoitti 18.03.2009 kello 18:00:
> Send Finland mailing list submissions to
> 	finland at lists.osgeo.org
> 
> To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit
> 	http://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/finland
> or, via email, send a message with subject or body 'help' to
> 	finland-request at lists.osgeo.org
> 
> You can reach the person managing the list at
> 	finland-owner at lists.osgeo.org
> 
> When replying, please edit your Subject line so it is more specific
> than "Re: Contents of Finland digest..."
> 
> 
> Today's Topics:
> 
>    1. Toimintaa ja organisoitumista Suomessa (Ari Jolma)
> 
> 
> ----------------------------------------------------------------------
> 
> Message: 1
> Date: Wed, 18 Mar 2009 10:13:04 +0200
> From: Ari Jolma <ari.jolma at tkk.fi>
> Subject: [OSGeo Suomi] Toimintaa ja organisoitumista Suomessa
> To: finland at lists.osgeo.org
> Message-ID: <49C0AD10.7060209 at tkk.fi>
> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1; format=flowed
> 
> Hei,
> 
> Tylerilta tuli viimehetken muistutus paikallisosastojen (local
>  chapters) 
> toiminnasta kertomisesta OSGeon vuosikertomusta varten. Laitoin
>  muutaman 
> rivin wikiin:
> 
> http://wiki.osgeo.org/wiki/Annual_Report_2008 ja
> http://wiki.osgeo.org/wiki/Finland_Chapter_Report_2008
> 
> Lýhinnýhýn me saatiin týmý sýhkýpostilista aikaiseksi ja nýyttiin 
> Paikkatietomarkkinoilla.
> 
> Olen mukana myýs ProGISsissa, sen johtokunnassa, siellý on asiaa 
> mietitty niin, ettý minun tehtývýalueekseni johtokunnan jýsenený on 
> vapaan lýhdekoodin asiat. Nyt huhtikuun 21. pýivýhýn ProGISsilla on 
> kevýtseminaari, jossa aihe on nimenomaan vapaa lýhdekoodi.
> 
> OSGeon johtokunnan kokouksissa (joita on kerran kuussa) on viime
>  aikoina 
> virallistettu aina yksi tai kaksi paikallisosastoa, eli kiinnostusta 
> sellaisiin on. Itsellýni on rajallisesti aikaa ja voimavaroja, joten en 
> ole kovin aktiivisesti vienyt organisoitumista eteenpýin týýllý.
>  Foorumi 
> on vapaa ehdotuksille ja aktiivisuudelle!
> 
> Yliopistomaailmassa erilaiset geoinformatiikka-alan organisoitumiset 
> ovat jonkinlaisen gravitaation vaikutuksesta tuottaneet FIUGINETin,
>  joka 
> on virallinen yliopistokonsortio geoinformatiikan alalla. Olen siinýkin 
> mukana johtokunnassa (Suomi on pieni maa). Sillý on kotisivut 
> http://geoinformatics.fi/ ja mm. avoin sýhkýpostilista. FIUGINETin 
> toiminta liittyy týllý hetkellý ehký eniten aineistojen vapaampaan 
> saatavuuteen tutkimukseen ja opetukseen. Siiný on edistytty aika hyvin 
> ja meillý on tulossa kaikille opiskelijoille ja yliopistolaisille avoin 
> aineiston latausportaali. Se on kyllý siiný mielessý jo vanhentunut, 
> ettý datojen suorakýyttý olisi nykyaikaa, mutta yhtený ongelmana on 
> autentikointi. Mielellýni olisin kehittýmýssý vapaaseen koodiin 
> perustuvaa geoinformatiikan tutkimus- ja oppimisympýristýý (vinkki: 
> konsortiota ja hakemuksia voisi kehitellý...).
> 
> Terveisin,
> 
> Ari
> 
> -- 
> Prof. Ari Jolma
> Environmental Planning and Management Informatics
> Teknillinen Korkeakoulu / Helsinki University of Technology
> tel: +358 9 4511 address: POBox 5300, 02015 TKK, Finland
> Email: ari.jolma at tkk.fi URL: http://geoinformatics.tkk.fi
> 
> 
> 
> 
> 
> ------------------------------
> 
> _______________________________________________
> Finland mailing list
> Finland at lists.osgeo.org
> http://lists.osgeo.org/mailman/listinfo/finland
> 
> 
> End of Finland Digest, Vol 7, Issue 1
> *************************************


...................................................................
Luukku Plus paketilla pääset eroon tila- ja turvallisuusongelmista.
Hanki Luukku Plus ja helpotat elämääsi. http://www.mtv3.fi/luukku